| 1 | J. Lorenzo (ESP) | Aprilia Fortuna | 43:12.237 | |
| 2 | A. Dovizioso (ITA) | Honda | 43:12.393 | |
| 3 | A. De Angelis (SMR) | Aprilia | 43:14.970 | |
| 4 | H. Barbera (ESP) | Aprilia Team Toth | 43:18.208 | |
| 5 | J. Simon (ESP) | Honda | 43:18.348 | |
| 6 | M. Simoncelli (ITA) | Gilera | 43:34.990 | |
| 7 | M. Kallio (FIN) | KTM | 43:35.376 | |
| 8 | Á. Bautista (ESP) | Aprilia | 43:39.653 | |
| 9 | S. Aoyama (JPN) | Honda | 43:41.152 | |
| 10 | A. West (AUS) | Aprilia Team Sicilia | 43:46.187 | |
| 11 | R. Wilairot (THA) | Thai Honda | 44:10.137 | |
| 12 | F. Lai (ITA) | Aprilia | 44:10.248 | |
| 13 | A. Baldolini (ITA) | Aprilia | 44:18.488 | |
| 14 | T. Sekiguchi (JPN) | Aprilia | 44:18.957 | |
| 15 | E. Laverty (IRL) | Honda | 44:19.886 | |
| 16 | D. Heidolf (DEU) | Aprilia | 44:27.074 | |
| 17 | A. Tizon (ESP) | Aprilia Blusens | 44:43.692 | |
| 18 | A. Espargaro (ESP) | Aprilia Blusens | 44:51.938 |