| 1 | H. Aoyama | Honda | 2:07.860 | ||||
| 2 | D. Pedrosa | Honda | 2:07.941 | ||||
| 3 | A. De Angelis | Aprilia | 2:08.195 | ||||
| 4 | C. Stoner | Aprilia | 2:08.265 | ||||
| 5 | S. Porto | Aprilia | 2:08.436 | ||||
| 6 | A. Dovizioso | Honda | 2:08.563 | ||||
| 7 | R. De Puniet | Aprilia | 2:08.762 | ||||
| 8 | H. Barberá | Honda | 2:09.552 | ||||
| 9 | S. Guintoli | Aprilia | 2:09.891 | ||||
| 10 | S. Corsi | Aprilia | 2:09.998 | ||||
| 11 | A. Ballerini | Aprilia | 2:10.039 | ||||
| 12 | A. Debon | Honda | 2:10.130 | ||||
| 13 | J. Smrz | Honda | 2:10.164 | ||||
| 14 | R. Locatelli | Aprilia | 2:10.212 | ||||
| 15 | D. Heidolf | Honda | 2:10.279 | ||||
| 16 | R. Rous | Honda | 2:10.304 | ||||
| 17 | A. West | KTM | 2:10.330 | ||||
| 18 | Y. Takahashi | Honda | 2:10.448 | ||||
| 19 | A. Baldolini | Aprilia | 2:10.808 | ||||
| 20 | C. Davies | Aprilia | 2:10.858 | ||||
| 21 | M. Giansanti | Aprilia | 2:10.888 | ||||
| 22 | S. Jenkner | Aprilia | 2:11.323 | ||||
| 23 | T. Sekiguchi | Aprilia | 2:11.825 | ||||
| 24 | M. Cardenas | Aprilia | 2:12.195 | ||||
| 25 | E. Nigon | Wildcard | 2:12.369 | ||||
| 26 | M. Gines | Wildcard | 2:12.509 | ||||
| 27 | A. Vincent | Fantic | 2:13.139 | ||||
| 28 | N. Cajback | Yamaha | 2:15.560 |